Pajūrio regioninio parko direkcijai yra priskirta prižiūrėti kai kurias Klaipėdos rajone esančias saugomas teritorijas už parko ribų.

Direkcija prižiūri:

Minijos ichtiologinį draustinį,

Minijos senslėnio draustinį,

„Natura 2000“ teritorijas už parko ribų:

Paukščių bei buveinių apsaugai svarbią teritoriją Minijos upėje bei jos slėniuose Klaipėdos rajone ir iki pat Nemuno deltos regioninio parko ribų Šilutės rajone;

Paukščių apsaugai svarbią teritoriją - Kalvių atkuriamąjį sklypą.

Kalvių karjeras